既然是停薪留职，那就是适龄劳动者，而你们单位如果是全日制用工，那双方应当是劳动关系，而非劳务关系，即使签订了劳务协议。所以解除时应当根据劳动合同法执行。不能胜任，需要调岗或培训，仍不能胜任，才能解除合同，并且需要支付经济补偿，另外如果没有提前三十天通知，还要支付一个月工资的代通知金。