1、员工自身疾病，不属于工伤，公司按照病假处理。但是这里要核实一点，即在白天工作时是否发病，是否有一定症状，如果有的话，且该员工已经死亡，有可能被认定为视为工亡，否则，不能认定为工亡，公司无赔偿责任。2、如果地方有非因工死亡补偿的相关规定，公司还是需要根据该规定，进行一定的补偿的。